Una de las tareas fundamentales del Departamento es impulsar la investigación en el campo de las matemáticas y sus aplicaciones. Un buen porcentaje de los profesores de tiempo completo del Departamento tienen formación como investigadores al contar con el grado de doctorado, y realizan investigación organizados en Cuerpos Académicos. Resultado de sus logros en investigación un profesor puede tener el reconocimiento de Perfil Prodep por parte de la SEP, o todavía más del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT).
